显微镜下结肠炎是只有在显微镜下才能看到的结肠炎症。它也被称为胶原性结肠炎，与结肠内层结缔组织的增厚层有关，或淋巴细胞性结肠炎，指的是白细胞水平的增加。根据Mayo诊所的网站，显微镜下的结肠炎可以是胶原性的，也可以是淋巴细胞性的。治疗包括改变生活方式和改变饮食以减轻症状。
特定碳水化合物饮食
特殊碳水化合物饮食(SCD)是一种流行的结肠炎饮食和无谷物、乳糖和蔗糖饮食。SCD计划的基础是相信肠道微生物、酵母和细菌与碳水化合物引起的肠道疾病有关。微生物靠碳水化合物中的糖大量繁殖，并能破坏肠壁细胞。SCD的工作原理是允许最小类型的碳水化合物更容易消化。
谷蛋白
据《分析师》和更精细的健康和营养网站称，导致乳糜泻或麸质过敏症的基因，也会导致微小结肠炎。据推测，结肠炎会影响免疫系统，引发乳糜泻，反之亦然。肯尼斯·法恩医生在更精细健康和营养网站上发表了一项研究，发现显微镜下结肠炎是乳糜泻患者腹泻的最常见原因。一些病人发现无谷蛋白饮食后症状明显减轻。
补充
慢性腹泻可导致吸收不良，从而导致营养不良。克罗恩斯和结肠炎基金会(Crohns and Colitis foundation)建议，多种维生素可以帮助补充营养，因为患者吃的很多东西可能不会被身体吸收。益生菌，或称有益菌，有助于保持消化系统的健康。该分析网站建议益生菌可能对那些患有微结肠炎的人有所帮助。益生菌产生特定的化合物，可以杀死不需要的微生物，如酵母和细菌。
液体
当涉及到腹泻时，脱水总是一个风险。慢性腹泻会增加脱水的风险，摄入足够的水分是必要的。根据Crohns和结肠炎基金会的网站，过度腹泻会增加肾功能不佳或肾结石的风险。水和盐的流失也会导致虚弱、头晕和头昏眼花。液体摄入需要跟上腹泻时流失的水分。
注意事项
虽然改变饮食可以帮助减轻显微镜下结肠炎的症状，但Crohns和结肠炎基金会网站警告说，没有一种饮食是最适合所有人的。梅奥诊所建议限制脂肪摄入，避免咖啡因、酒精和辛辣食物。有些人很好地避免了奶制品。在改变你的饮食或添加补充剂之前，一定要先咨询你的医生。